Chirurgický základní kmen probíhá v celkové délce 30 měsíců. Úvodní část tvoří šestiměsíční všeobecný základ, který zahrnuje 2 měsíce na anesteziologii a intenzivní medicíně, 2 měsíce na chirurgii a 2 měsíce na vnitřním lékařství. Zbývajících 24 měsíců je vyhrazeno pro specializovanou praxi v chirurgii. Z tohoto čtyřiadvacetiměsíčního bloku musí lékař povinně strávit 3 měsíce v akreditovaném zařízení, jež zajišťuje péči v akutní traumatologii v minimálním rozsahu 500 ošetření traumat a 30 osteosyntéz ročně (či v průměru za poslední 3 roky). Pro školence zařazené ve specializačních oborech cévní chirurgie, dětská chirurgie nebo gastroenterologie platí výjimka, kdy mohou až 6 měsíců z této čtyřiadvacetiměsíční praxe absolvovat přímo v akreditovaném zařízení pro tyto konkrétní obory.

Před přihlášením ke kmenové zkoušce je nutné absolvovat 5 povinných kurzů: Lékařská první pomoc (20 hodin), Základy zdravotnické legislativy, etiky a komunikace (12 hodin), Prevence škodlivého užívání návykových látek a léčba závislostí (4 hodiny), Radiační ochrana (4 hodiny) a odborný kurz Základy chirurgie v rozsahu 30 hodin.

Z hlediska chirurgické praxe musí lékař splnit a nechat si potvrdit následující minimální počty samostatných výkonů a asistencí:

• 30 ošetření komplikovaných a nekomplikovaných ran.

• 30 konzervativních ošetření poranění kloubů a měkkých tkání včetně imobilizačních technik.

• 20 konzervativních léčeb zlomenin, jako jsou repoziční manévry, trakční techniky či sádrování.

• 20 asistencí na operačním sále u končetinových poranění, například u vnitřních osteosyntéz, aplikací zevních fixatérů či artroskopií.

• 25 asistencí u větších nitrobřišních výkonů včetně laparoskopií.

• 15 asistencí a 10 samostatně provedených operací volné a uskřinuté kýly.

• 15 asistencí a 10 samostatně provedených apendektomií.

• 10 operací povrchových hlíz, furunklů a benigních kožních tumorů.

• 10 amputací na končetinách.

• 5 zavedení centrálního žilního katetru a 5 punkcí či drenáží hrudníku.

• 5 asistencí při operacích nebo samostatných operací varixů dolních končetin.

• 5 asistencí u malých výkonů v oblasti anu.

• 2 asistence na operačním sále u dutinových poranění.